en los libros de fábrica se asentaban los gastos realizados en el marco de obras o reformas edilicias en carpintería, mampostería, albañilería, agrimensura, herrería (pago de tales trabajos), la adquisición de materiales y herramientas para dicho fin (ladrillos, polvo, arena, tablas, baldosas, pintura, etc.), así como la compra de objetos varios que fueron utilizados de forma ornamental en la iglesia (por ejemplo, estatuas para el retablo) y otros sectores del Convento, entre otras cuestiones. En esta serie también fueron incorporados algunos documentos que no formaban parte de los llamados Libros de Fábrica sino que eran documentos sueltos que responden a la misma función: el informe con directivas para la construcción del edificio conventual del Colegio San Carlos, firmado por Isidro Lorea (sin fecha), y el informe con diagnóstico y proyectos/soluciones para los problemas edilicios, que presenta una firma de difícil lectura, sin fecha (posiblemente José de Castro, maestro de obra)

es la producción documental que refleja las actividades administrativas llevadas a cabo por la figura en cuestión, que sobrepasan la mera administración ordinaria implementada por el procurador ya que implican acciones de carácter legal y jurídico. Dichas acciones se ven plasmadas en documentación donde constan actos jurídicos, como ser la compraventa de bienes raíces o acuerdos entre partes.
La presente subsección está conformada por las siguientes series documentales:
-Operaciones de propiedades inmuebles

• Actas
• Contratos
• Comprobantes
• Correspondencia

este nivel está conformado por la documentación producida en la labor pedagógica de la Orden en relación a la promoción de nuevas vocaciones, primero en el ámbito del Colegio San Carlos y, luego de su creación a fines del siglo XIX, en el Colegio Seráfico como institución dependiente del Convento. Contiene: diferentes tipologías documentales que podrían clasificarse dentro del concepto amplio “Normativa” y que regulan y ordenan el funcionamiento de la institución y sus relaciones con los demás cargos orgánicos dentro del Convento; otras tipologías específicas vinculadas a los movimientos administrativos necesarias para la concreción de las actividades de formación del Colegio Seráfico -como ser los Libros de Fábrica, Libros de Administración y Libros de Gastos (entradas y salidas) y comprobantes varios de transacciones económicas-; y documentos directamente relacionados al diseño curricular y las modalidades de aprobación del mismo.
Series:
-Normativa
-Libros de Fábrica
-Libros de Administración
-Libros de Gastos (entradas y salidas)

• Comprobantes
• Planillas de clasificaciones
• Libreta de caja de ahorro

Se encuentra conformada por las siguientes series facticias: sermones/homilías, partituras musicales, apuntes históricos (redactados por religiosos que demostraron interés por el conocimiento histórico y que incluyeron en sus investigaciones información extraída de los documentos del archivo), referencias periodísticas e himnos.

las series se corresponden con las diferentes misiones dependientes del Colegio San Carlos en diversos períodos históricos, y contienen las siguientes sub series, aplicables a todas ellas: informes, correspondencia, economía y gestión, escuela, crónicas.
Contiene la documentación generada por los misioneros asignados en el cargo de superior de cada misión, a través de los cuales debían dejar constancia de todo lo que aconteciera en sus jurisdicciones, dando así origen a los diferentes libros y tipologías documentales varias que reflejan sus actividades evangélicas en la zona de destino. En ellos se detallan diversas cuestiones como ser la administración de los santos sacramentos del bautismo, el matrimonio, la celebración de las misas, la descripción detallada de poblaciones indígenas reducidas, terrenos, edificios, actividades agrícolas y ganaderas, etc.

Series, ordenadas por fecha de fundación de las misiones:

• Jesús Nazareno de Espín
• San Jerónimo del Rey/ del Sauce
• San Pedro
• San Javier
• Santa Rosa de Calchines
• San Antonio de Obligado
• San Martín Norte
• Nueva Pompeya
• San Francisco de Asís del Laishí
• San Francisco Solano de Tacaaglé