este nivel incluye documentación de carácter normativo para la adaptación de las reglamentaciones generales al gobierno de las misiones en su especificidad, la elaboración periódica de relaciones de naturaleza descriptiva e informativa sobre el estado de las misiones y las tareas realizadas, y documentación de tenor administrativo y contable relativa, por ejemplo,a la adquisición de bienes para las misiones o a los gastos de los traslados del Prefecto por las distintas regiones con reducciones. Dada las características del circuito documental, algunas de las series (Correspondencia y Copias para archivar) refieren a la documentación que la prefectura recibía proveniente de las misiones a su cargo y que debían ser guardados en el Archivo de la Prefectura existente en el Colegio San Carlos, en la cual los Superiores informaban al Prefecto sobre el crecimiento demográfico del poblado y estado económico del mismo, entre otras cuestiones, informes que luego éste elevaba a su vez a las autoridades nacionales.
Series documentales:

• Normativa
• Correspondencia
• Informes
• Economía y gestión
• Crónicas
• Copias para archivar
• Antecedentes de la Administración de Reducciones de Indios

en la copia de la primera acta, fechada en el año 1801 y registrada en el [Libro en el que se exponen los medios y arbitrios que se han practicado en el Colegio de San Carlos], se designan los cargos necesarios para fundar y formalizar a la V.O.T. Entre los nombramientos más significativos del primer capítulo se pueden mencionar los siguientes: ministro, discretos, secretario, maestro de novicios, celadores, síndico y procurador de limosnas.
La segunda de ellas, que da cuenta de la elección de autoridades para el funcionamiento de la institución terciaria, se encuentra basada en los estatutos generales de la mencionada Orden y es fechada en el año 1803, siendo refrendada por Fr. Thadeo García como Presidente de la elección, Fr. Thomás Orio en el rol de Rector y Pedro Luján su ministro.
Además de las elecciones se registran las resoluciones tomadas por las autoridades y los pedidos de ingreso.
Todos los libros, exceptuando el correspondiente al año 1886, incluyen las actas junto con los acuerdos capitulares.
Actas de la V.O.T:
[Libro 1 de Actas Capitulares de la V.O.T de San Lorenzo y demás congregaciones dependientes] 1886-1898, Armario 8
[Libro 2° de Actas de los Capítulos y Sesiones de la Junta de la V.O.T. de San Lorenzo] 1873 - 1892, Armario 1
[Libro 2 de Actas Capitulares de las Hermanas Terceras de la V.O.T de San Lorenzo] 1905 - 1935
[Primer Libro de Actas Capitulares y Acuerdos de las Hermanas Terceras de San Lorenzo] 1892, Armario N° 8
[Primer Libro de Actas Capitulares y Acuerdos de las Hermanos Terceros de San Lorenzo] 1892, Armario N° 8

Los primeros registros de toma del santo hábito corresponden al año 1800, siendo este dato recuperado en el libro 1° y que fuera inaugurado en 1807. Las últimas registradas en el libro 5° corresponden al año 1967.
Además de los datos mencionados anteriormente, en algunos de estos libros se anotaron a los postulantes que deseaban ser ingresados junto con la presentación de su linaje para ser considerados como aptos y a los padrinos que acompañaban al profeso.
En determinados ejemplares se dejó constancia de los hermanos que han abandonado la institución, los que han fallecido y el pago de las anualidades. Ocasionalmente se detallaron las deudas de pagos pendientes, la cancelación posterior de las mismas efectuada por alguna persona allegada al difunto, y en el caso de haberlo hecho, las misas correspondientes celebradas en su honor.
En esta documentación se observa frecuentemente la firma de diferentes autoridades de la Junta Directiva -ya sean el Rector, el Guardián, el Secretario, el Ministro General, etc- con el fin de darle validez al acto de la persona que profesa.
Entre las personalidades terciarias destacadas que se pueden encontrar en la documentación se pueden citar a la Sra. María Catalina Echevarría de Vidal, quien cosió la bandera izada por Manuel Belgrano el 27 de febrero de 1812; los gobernadores Nicasio Oroño y su esposa Joaquina Cullen de Oroño y Pascual Rosas junto a su esposa Eusebia.

Libros de Recepción de hábitos y Profesiones de la V.O.T.:
[Libro N° 1 de Recepción de hábitos y profesiones de la V.O.T. del Colegio San Carlos], 1800-1864
[Libro N° 2 de Recepción de hábitos y profesiones de la V.O.T. del Colegio San Carlos], 1845-1886
[Libro N° 3 de Recepción de hábitos y profesiones de la V.O.T. del Colegio San Carlos], 1873-1883
[Libro N° 4 de Recepción de hábitos, profesiones de la V.O.T. del Colegio San Carlos], 1898- 1921
[Libro N° 5 de Recepción de hábitos y profesiones de la V.O.T. del Colegio San Carlos], 1865 -1967

en estos asientos administrativos se deja constancia del capital que los terciarios administraban para el mantenimiento de su institución. Gran parte del mismo provenía del cobro de las luminarias, colectas, de limosnas y de los estipendios determinados para cada una de las celebraciones practicadas. El dinero que salía de la caja era utilizado para el pago de misas de regla, funerales, compras de estampas, escapularios, construcción de nichos en el cementerio, suscripciones para recibir el períodico católico “El Plata”, etc.
En el interior de uno de ellos se encuentran además los libros de notas y circulares, como así también los de inventario. En estos últimos se anotaba cada uno de los objetos destinados al culto, detallando las imágenes o altares adquiridos por los terciarios, el mobiliario, los libros de uso, los pertenecientes al archivo y con una nota al final firmada por Fr. Ignacio Scapigliatti, fechada en el año 1899, mediante la cual se hace mención sobre la pertenencia de un cementerio terciario propio.
En una nota del año 1902 firmada entre otros por el rector Fr. Francisco Giuliano y la tesorera Pilar de Camicera y el secretario Manuel Vazquez, se resuelve llevar por separado las cuentas de las Hnas. Terciarias de los Hnos. Terciarios que hasta el momento se registraban en común.
Por fuera del formato libro, dentro de la “Caja 31 Actas de las Elecciones de las Autoridades de V.O.T de Penitencia: 1800 -1820”, se han encontrado dos documentos fechados en la primera etapa de la fundación de la institución terciaria que refieren al control del dinero. El primero de ellos data del 19/02/1809 y fue realizado por el síndico de la V.O. Antonio Francisco Alonso Aldao. El segundo data del 22/02/1810 y lo firma el síndico José Lino Rodríguez.
Libros contables, de notas y circulares e inventarios:
[Libro de Caja de la V.O T. 1874-1892]
[Libro de Caja V.O.T 1893-1905]
[Libro de Caja V.O.T. 1905-1936]
[Libro de Notas V.O.T.1873]
[Libro de Inventario de la V-O.T. 1899]
[Libro de Inventario de la V-O.T. 1913]

el fondo contiene documentación del periodo comprendido entre fines del siglo XVIII y principios del siglo XXI, reflejo del accionar institucional de la Orden Franciscana en San Lorenzo y la región. La documentación es de tipología simple y compuesta, manuscritos, mecanografiados e impresos, mediante la cual se evidencia el ejercicio de las funciones y actividades específicas de la organización, que se pueden ver reflejadas en el cuadro de clasificación orgánico-funcional confeccionado en 2022.