se denomina así al registro en el que se detallan la administración de las celebraciones que se oficiaron en el Convento/Colegio de San Carlos desde su fundación hasta 1993 en el que se anotaban la intención, la ofrenda y el cumplimiento del encargo. Algunos de estos ejemplares pueden estar divididos en Libros de misas recibidas y aplicadas además de registrarse en los mismos las variadas tipologías de misas de acuerdo a lo siguiente: con estipendio, sin estipendio, cantadas, de manto, urgentes, manuales, total.
Sin embargo, en los registros más actuales solo se anotan la fecha, la intención del donante, el lugar y el celebrante.
El estipendio se define como una ofrenda de carácter voluntario para que el sacerdote aplique la misa por una determinada intención las cuales pueden celebrarse por personas vivas o difuntas. Con la donación de esta ofrenda los fieles contribuyen en el progreso y sustento de las actividades siendo a veces la única forma de ingreso.
El inicio y cierre de los libros son autorizados y aprobados por los superiores en la Santa Visita Canónica en el que toda la documentación administrativa es revisada, cotejada y refrendada por el Comisario Visitador. Previamente, el Guardián junto a los Discretos aprueba los movimientos registrados.
Según los Estatutos Municipales de 1895 del Apostólico Colegio de San Carlos “Todas las misas deberán ser aplicadas según la intención del encargado de ellas. Pero se concede a cada sacerdote que pueda aplicar una misa cada mes según su propia intención, para la cual deberá dar aviso ante el encargado de ellos.
El Sacristán Mayor llevará escrupulosamente los libros tanto de entrada como de aplicaciones de misas sean encargadas o gratuitas, y tendrá en una caja especial las limosnas de ellas y al fin de mes se incorporará a las limosnas comunes la limosna correspondiente a las misas aplicadas en él”. Sin embargo,En la Santa visita Canónica del 15 de mayo de 1925 asentada en el libro 3 en que se asientan las elecciones capitulares y los decretos de visita de 1877-1930 se ordena en el punto 4° que, “el Reverendo Padre Director de las Misas haga los asientos correspondientes a la administración de ellas en los libros Ad Hoc destinados y autorizados” firmado por: Fr. Alberto Lanna (Comisario Provincial y Fray Luis Persiani Secretario provincial)
Los diferentes tipos de misas se definen de la siguiente manera:
-Misa aplicada: se suele dar un estipendio al sacerdote el cual una especie de limosna que se da al sacerdote para sus gastos. Por norma solo se puede cobrar un estipendio por día aunque tenga que decir varias misas.
-Misa cantada: aquella en la cual el sacerdote canta las partes que le corresponde: salutaciones, oraciones, prefacio, padrenuestro. Con frecuencia se designa también con esta expresión la misa celebrada sin asistencia del diácono y en la que el sacerdote canta incluso las partes que le corresponden a este.
-Misa de manto: son misas solemnes que se celebran para el cambio de manto de la virgen.
-Misa Gregoriana: consiste en la celebración de treinta misas durante treinta días seguidos por una misma intención, generalmente el eterno descanso del alma de un difunto
-Misa Pro populo: es aquella cuyo precepto divino obliga a los Obispos y Párrocos a aplicar la misa por el pueblo. En el libro 3 en el que se asientan las elecciones capitulares y decretos de visita se establece en el punto 14 que “se anoten en libros separados las misas pro populo, por formar parte del archivo parroquial”

En el libro 3 en el que se asientan las elecciones capitulares y los decretos de visita y autos de visita canónica del 10 de marzo de 1926 se establece en el punto 13: “se abra un nuevo libro, para anotar en él, las misas por los religiosos difuntos, las gratis y todas aquellas que ordenasen los superiores mayores”.